Родился в 1954 году. В 1977 году окончил 1-й Ленинградский медицинский институт им. акад. И. П. Павлова. Доктор медицинских наук (1992), профессор (1994), С 1994 по 2001 годы — проректор по научной работе Санкт-Петербургского государственного медицинского университета им. И. П. Павлова. С 1997 года по настоящее время заведует кафедрой факультетской терапии университета. С 2001 года Е. В. Шляхто возглавляет Северо-Западный федеральный медицинский исследовательский центр имени В. А. Алмазова — одно из ведущих научно-лечебных учреждений страны, осуществляющее фундаментальные и прикладные исследования в области кардиологии и сердечно-сосудистой хирургии, гематологии, ревматологии, эндокринологии, педиатрии, молекулярной биологии и генетики, клеточных, информационных и нанотехнологий; оказание специализированной, в том числе высокотехнологичной, медицинской помощи населению; подготовку научных, врачебных кадров в рамках создания современной системы непрерывного последипломного медицинского образования. Евгений Владимирович Шляхто является признанным научным авторитетом, внесшим крупный вклад в развитие науки, подготовку научно-педагогических кадров. Им создана известная в России и за рубежом научная школа, отличительными чертами которой является междисциплинарный подход к комплексному решению актуальных научно-практических проблем современной медицины. Учениками Е. В. Шляхто, под его непосредственным руководством и при научном консультировании, защищено 20 докторских и 56 кандидатских диссертаций. Результаты многолетних исследований Е. В.Шляхто в области диагностики и лечения сердечно-сосудистых заболеваний обобщены более чем в 700 публикациях, 16 изобретениях и 2 открытиях, ряде монографий и учебников для ВУЗов — «Пограничная артериальная гипертензия» (1992), «Почки и артериальная гипертензия» (1999), «Метаболический сердечно-сосудистый синдром” (1999) «Гипертоническая болезнь» (2001), «Вегетативная нервная система и артериальная гипертензия» (2008), «Ремоделирование сердечно-сосудистой системы при артериальной гипертензии» (2009), «Барорецепторный рефлекс и долговременная регуляция артериального давления» (2011), учебники для ВУЗов — «Болезни органов кровообращения» (1997), «Эндокринология» (2005, 2-е издание — 2007), «Внутренние болезни» (2000, 2008), «Кардиопротекция: фундаментальные и клинические аспекты» (2013). По инициативе и под редакцией Е. В. Шляхто осуществлен перевод на русский язык и издание Европейского руководства по сердечно-сосудистым заболеваниям (2010). Новым направлением работы Е. В. Шляхто являются исследования в области нанотехнологий и наноматериалов, направленные на создание медицинских технологий «прорывного характера», имеющих фундаментальное значение для научного обеспечения высокотехнологичной помощи больным с сердечно-сосудистыми, эндокринными заболеваниями и болезнями крови. Под руководством Е. В. Шляхто в Центре ведутся интенсивные исследования в области трансляционной медицины: технологий молекулярной диагностики, разработки диагностических средств персонализации терапии, клеточной и тканевой инженерии для терапевтических целей, создания биосовместимых материалов и тканеинженерных конструкций, организован банк биологических образцов — тканей, клеток и генетического материала. Результатом этих работ стали книги «Нанотехнологии в биологии и медицине» (2009), «Трансляционная медицина» (2010). Е. В. Шляхто в составе коллектива авторов стал лауреатом премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники 2009 года за «Комплекс работ по созданию и внедрению в Российской Федерации современных методов диагностики, лечения и реабилитации больных хронической сердечной недостаточностью различного генеза». Среди других наград академика Шляхто — Премия Правительства Санкт-Петербурга и Санкт-Петербургского Научного центра РАН за выдающиеся достижения в области науки и техники в номинации «физиология и медицина» — премия имени И. П. Павлова (2011), VI Ежегодная национальная премия «Известность» в номинации «Здоровье» (2011). В 2009 году Евгений Владимирович был награжден Почетной грамотой Правительства Российской Федерации за большой вклад в развитие здравоохранения и многолетнюю плодотворную деятельность, в 2012 году — Орденом Почета за достигнутые трудовые успехи и многолетнюю добросовестную работу. Среди наград текущего 2014 года — Премия Правительства Санкт-Петербурга за выдающиеся достижения в области высшего и среднего образования в номинации «Научные достижения, способствующие повышению качества подготовки специалистов и кадров высшей квалификации» и медаль Министерства здравоохранения РФ «За заслуги перед отечественных здравоохранением». Академик Шляхто уделяет значительное внимание общественно-научной и организационной работе, направленной на повышение авторитета российской науки: он — Президент Российского кардиологического общества, главный редактор журналов «Российский кардиологический журнал», «Трансляционная медицина», входит в состав редакционных коллегий ряда других российских и зарубежных журналов.